虽然8个认定条件可以都满足，但是其中研发费用归集不合理就可能前功尽弃了。从研发费用的数据和归集路径可以反映出企业的技术和管理水平。而且研发费用还关系到了企业切身利益，因为企业有了研发费用可以申报多个政府补贴项目。比如高新技术企业认定、高新技术企业培育、研发资助、加计扣除等，研发费用多少直接影响到了补贴金额的多少。下面就对高新认定中研发费用的重点和难点进行分析。

（1）研发费用占销售收入比例的把握

企业研究开发费用占比是企业近三个会计年度（实际经营期不满三年的按实际经营时间计算）的研究开发费用总额占同期销售收入总额的比值。《管理办法》要求：最近一年销售收入小于5,000万元（含）的企业，比例不低于5%；最近一年销售收入在5,000万元至2亿元（含）的企业，比例不低于4%；最近一年销售收入在2亿元以上的企业，比例不低于3%。其中，企业在中国境内发生的研究开发费用总额占全部研究开发费用总额的比例不低于60%；销售收入为主营业务收入与其他业务收入之和。主营业务收入与其他业务收入按照企业所得税纳税申报表的口径计算。

关于研发费用归集要在每个季初进行规划，财务部和研发部需要密切配合，财务部可以给研发部一个指导性方案，因为只能在管理费用归集，不能从主营业务成本成本从挖补，所以平时研发部应注意收集相关单据，季末检测研发费用在销售收入的占比，使得占比符合《管理办法》规定的范围内。

（2）企业研究开发活动（研发项目）的确定

研发活动的确定方法与此前类似，包括行业标准判断法、专家判断法和目标或结果判定法。其中，目标或结果判定方法是前两种方式的辅助方法。企业应按照研究开发活动的定义填写高新技术企业认定申请书中“企业研究开发活动情况表”。

（3）研发费用的归集方法

企业应正确归集研发费用，由具有资质并符合《工作要领》相关条件的中介机构进行专项审计或鉴证。企业的研究开发费用是以单个研发活动为基本单位分别进行测度并加总计数的。以单个研发活动为基本单位则省去了运用费用分摊机制的麻烦。企业应对包括直接研究开发活动和可以计入的间接研究开发活动所发生的费用进行归集，并填写《高新技术企业认定申请书》中的“企业年度研究开发费用结构明细表”。企业应按照“企业年度研究开发费用结构明细表”设置高新技术企业认定专用研究开发费用辅助核算账目，提供相关凭证及明细表，并按要求进行核算。

（4）研发费用的归集范围

包括人员人工费用；直接投入费用；折旧费用及长期待摊费用；无形资产摊销费用；设计费用；装备调试费用与试验费用；委托外部研究开发费用和其他费用，并且其他费用由不得超过研究开发总费用的20%，包括技术图书资料费、资料翻译费、专家咨询费、高新科技研发保险费，研发成果的检索、论证、评审、鉴定、验收费用，知识产权的申请费、注册费、代理费，会议费、差旅费、通讯费等其他费用所占比例有所提高。